MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 2236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018887	A	6	6	6	11	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018887	TA	3	6	59	64	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018887	TAT	3	9	69	77	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018887	AT	3	6	699	704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018887	AC	3	6	705	710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018887	CAA	2	6	726	731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018887	A	7	7	3277	3283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018887	TAA	2	6	3298	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018887	ATT	2	6	3318	3323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018887	TAT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018887	AAT	2	6	3338	3343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018887	A	6	6	3364	3369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018887	TAC	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018887	ATT	2	6	4675	4680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018887	ATA	2	6	5187	5192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018887	CAC	2	6	5200	5205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018887	TTC	2	6	5237	5242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018887	CTTT	2	8	6277	6284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018887	T	8	8	7388	7395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018887	T	7	7	7397	7403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018887	GCT	2	6	7404	7409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018887	A	7	7	7420	7426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018887	TAA	2	6	7433	7438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018887	AATTT	2	10	8310	8319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018887	TTAT	2	8	8335	8342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018887	AT	3	6	8341	8346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018887	TAT	2	6	8351	8356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018887	A	7	7	11403	11409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018887	CAAC	2	8	11460	11467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018887	A	6	6	11494	11499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018887	A	6	6	15650	15655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018887	A	10	10	15664	15673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018887	GAA	2	6	15674	15679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018887	A	8	8	15738	15745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018887	A	7	7	15747	15753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018887	T	8	8	15767	15774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018887	AAGT	2	8	15795	15802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018887	GAAAAA	2	12	15840	15851	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018887	A	8	8	15847	15854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018887	A	9	9	15874	15882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018887	TAT	2	6	15890	15895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018887	A	6	6	15910	15915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018887	TCC	2	6	19987	19992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018887	TAAT	2	8	20000	20007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018887	AAT	2	6	20041	20046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018887	ATTTTA	2	12	22137	22148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018887	AATTA	2	10	22771	22780	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018887	TTA	2	6	25655	25660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018887	TAT	2	6	25661	25666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018887	TAA	2	6	25698	25703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018887	ATTT	2	8	25722	25729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018887	TAA	2	6	25737	25742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018887	AAT	2	6	25751	25756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018887	TAA	3	9	31547	31555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018887	TTA	2	6	32110	32115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018887	TAT	2	6	32123	32128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018887	A	6	6	32150	32155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018887	TATT	2	8	38139	38146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018887	AAC	2	6	39654	39659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018887	TAA	2	6	39663	39668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018887	TAA	2	6	39679	39684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018887	ACT	2	6	39689	39694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018887	A	6	6	39709	39714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018887	TAT	2	6	39756	39761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018887	A	8	8	39768	39775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018887	TC	3	6	39803	39808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018887	ATT	2	6	40707	40712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018887	TTC	2	6	40715	40720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018887	ATTT	2	8	40728	40735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018887	AAT	2	6	40753	40758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018887	AT	3	6	41626	41631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018887	TAA	2	6	45386	45391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018887	TAA	2	6	45410	45415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018887	ATAA	2	8	45994	46001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018887	TCC	2	6	46385	46390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018887	AATT	2	8	46425	46432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018887	A	10	10	46443	46452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018887	TAA	2	6	46475	46480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018887	T	8	8	46502	46509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018887	AAGTA	2	10	46514	46523	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018887	ATG	2	6	46573	46578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018887	ATA	2	6	46607	46612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018887	TCT	2	6	46619	46624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018887	A	6	6	46668	46673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018887	AAAT	2	8	46676	46683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018887	AAGC	2	8	46843	46850	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018887	CAA	2	6	46893	46898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018887	CT	3	6	46901	46906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018887	ACA	2	6	47076	47081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018887	TAC	2	6	47083	47088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018887	ACTAA	2	10	47102	47111	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018887	TAA	2	6	47119	47124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018887	TAC	2	6	47186	47191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018887	ATT	2	6	47205	47210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018887	T	7	7	47218	47224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018887	A	7	7	47225	47231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018887	ATT	2	6	47235	47240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018887	ATT	2	6	47260	47265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018887	ATT	2	6	47329	47334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018887	AT	3	6	47346	47351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018887	TC	3	6	47364	47369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018887	A	8	8	47382	47389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018887	A	7	7	47394	47400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018887	TTG	2	6	47546	47551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018887	ATAA	2	8	47838	47845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018887	A	6	6	47844	47849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018887	TAAT	2	8	47862	47869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018887	AT	3	6	49283	49288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018887	TA	3	6	49310	49315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018887	TAA	2	6	50008	50013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018887	ATT	2	6	50029	50034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018887	A	6	6	50045	50050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018887	TTA	2	6	52393	52398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018887	TCC	2	6	53431	53436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018887	T	7	7	53439	53445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018887	ATT	2	6	53464	53469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018887	TAA	3	9	53481	53489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018887	AT	3	6	56728	56733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018887	ACAT	2	8	56743	56750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018887	TAAAT	2	10	56760	56769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018887	TATTT	2	10	56770	56779	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018887	C	6	6	57152	57157	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_018887	TAA	3	9	57191	57199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018887	TAT	2	6	57949	57954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018887	AATC	2	8	57959	57966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018887	TAA	2	6	58362	58367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018887	ATTT	2	8	59004	59011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018887	ATT	3	9	59023	59031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018887	CAAA	2	8	60496	60503	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018887	A	7	7	60501	60507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018887	AAT	2	6	63016	63021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018887	A	11	11	63031	63041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018887	A	7	7	65701	65707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018887	GAAA	2	8	70084	70091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018887	AAAT	2	8	70092	70099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018887	GGA	2	6	70128	70133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018887	A	6	6	70143	70148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018887	GAAA	2	8	70178	70185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018887	AAG	2	6	70225	70230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018887	TTA	2	6	70231	70236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018887	A	6	6	70253	70258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018887	CAA	2	6	70286	70291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018887	TG	3	6	70312	70317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018887	ATT	2	6	70320	70325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018887	TAG	2	6	70343	70348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018887	AGA	2	6	70415	70420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018887	T	6	6	70439	70444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018887	ATTC	2	8	70449	70456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018887	A	7	7	72794	72800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018887	ATA	2	6	72814	72819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018887	A	6	6	79285	79290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018887	A	6	6	79316	79321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_018887	GAA	2	6	217029	217034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_018887	ATA	2	6	217164	217169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_018887	AAT	2	6	236915	236920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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